Una de las ventajas de APPBOSA es contar con la certificación orgánica. Para lograrlo se inició una ardua tarea en el mes de marzo del 2006 contando la participación profesional del Ing. Jim Wilson Ruiz García y del socio Hilario Atoche Ancajima. Luego de cumplir con todos los requisitos, se logró obtener la certificación orgánica beneficio que ha significado exportar hacia Europa y el mercado de Estados Unidos.
APPBOSA cautela los procesos para mantener la certificación como un elemento que contribuye al crecimiento de la Asociación.
Entiéndase como certificación orgánica al documento que emite el Organismo de Certificación, Control Union Perú con el que garantiza y confirma que existe la confianza adecuada de que el producto que ofrece APPBOSA cumple con las normas o reglas establecidas por nuestros clientes.